Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT28Q7Z3Y7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT28Q7Z3Y7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms