Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM47EQ6ZV65 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM47EQ6ZV65 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms