Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ALS2CLQ60I27 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALS2CLQ60I27 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms