Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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COL5A1-AS1Q5SY13 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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COL5A1-AS1Q5SY13 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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COL5A1-AS1Q5SY13 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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COL5A1-AS1Q5SY13 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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COL5A1-AS1Q5SY13 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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COL5A1-AS1Q5SY13 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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