Protein–RNA interactions for Protein: Q5NUL3

FFAR4, Free fatty acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR4Q5NUL3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FFAR4Q5NUL3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms