Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
GAPVD1Q14C86 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
GAPVD1Q14C86 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms