Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CKAP5Q14008 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CKAP5Q14008 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
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