Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EXOSC2Q13868 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EXOSC2Q13868 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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