Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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PTPRSQ13332 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRSQ13332 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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PTPRSQ13332 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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PTPRSQ13332 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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PTPRSQ13332 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
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PTPRSQ13332 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRSQ13332 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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