Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRN3Q0VDG4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRN3Q0VDG4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRN3Q0VDG4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRN3Q0VDG4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRN3Q0VDG4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRN3Q0VDG4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRN3Q0VDG4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCRN3Q0VDG4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCRN3Q0VDG4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms