Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ID3Q02535 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ID3Q02535 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ID3Q02535 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ID3Q02535 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ID3Q02535 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ID3Q02535 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ID3Q02535 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ID3Q02535 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ID3Q02535 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ID3Q02535 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ID3Q02535 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ID3Q02535 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ID3Q02535 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ID3Q02535 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ID3Q02535 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ID3Q02535 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ID3Q02535 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ID3Q02535 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ID3Q02535 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ID3Q02535 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ID3Q02535 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ID3Q02535 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ID3Q02535 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ID3Q02535 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ID3Q02535 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ID3Q02535 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ID3Q02535 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ID3Q02535 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ID3Q02535 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ID3Q02535 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ID3Q02535 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ID3Q02535 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ID3Q02535 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ID3Q02535 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms