Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSDMDP57764 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms