Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2A2P52657 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2A2P52657 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms