Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
SMARCA2P51531 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
SMARCA2P51531 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms