Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERFP50548 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERFP50548 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERFP50548 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERFP50548 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERFP50548 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERFP50548 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERFP50548 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERFP50548 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERFP50548 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERFP50548 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERFP50548 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERFP50548 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERFP50548 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERFP50548 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERFP50548 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERFP50548 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERFP50548 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERFP50548 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERFP50548 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERFP50548 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERFP50548 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERFP50548 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERFP50548 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERFP50548 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERFP50548 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERFP50548 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERFP50548 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERFP50548 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERFP50548 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERFP50548 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERFP50548 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERFP50548 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERFP50548 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERFP50548 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERFP50548 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERFP50548 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERFP50548 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ERFP50548 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERFP50548 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERFP50548 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERFP50548 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERFP50548 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERFP50548 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERFP50548 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERFP50548 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERFP50548 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERFP50548 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERFP50548 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERFP50548 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERFP50548 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERFP50548 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERFP50548 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ERFP50548 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERFP50548 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERFP50548 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERFP50548 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ERFP50548 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERFP50548 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERFP50548 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERFP50548 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERFP50548 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERFP50548 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERFP50548 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERFP50548 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERFP50548 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERFP50548 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERFP50548 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERFP50548 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERFP50548 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERFP50548 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERFP50548 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERFP50548 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ERFP50548 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms