Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPIAP49247 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPIAP49247 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPIAP49247 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPIAP49247 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPIAP49247 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPIAP49247 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPIAP49247 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPIAP49247 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPIAP49247 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPIAP49247 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPIAP49247 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RPIAP49247 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RPIAP49247 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPIAP49247 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPIAP49247 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPIAP49247 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPIAP49247 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPIAP49247 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPIAP49247 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPIAP49247 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPIAP49247 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPIAP49247 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPIAP49247 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPIAP49247 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPIAP49247 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPIAP49247 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPIAP49247 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPIAP49247 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPIAP49247 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPIAP49247 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPIAP49247 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPIAP49247 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPIAP49247 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPIAP49247 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPIAP49247 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPIAP49247 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPIAP49247 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPIAP49247 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPIAP49247 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPIAP49247 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPIAP49247 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPIAP49247 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPIAP49247 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPIAP49247 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPIAP49247 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPIAP49247 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPIAP49247 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPIAP49247 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPIAP49247 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPIAP49247 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPIAP49247 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPIAP49247 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPIAP49247 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPIAP49247 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms