Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPHP41219 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPHP41219 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPHP41219 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPHP41219 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPHP41219 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPHP41219 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPHP41219 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPHP41219 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPHP41219 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPHP41219 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPHP41219 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPHP41219 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPHP41219 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPHP41219 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPHP41219 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPHP41219 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPHP41219 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPHP41219 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPHP41219 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPHP41219 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPHP41219 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPHP41219 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPHP41219 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRPHP41219 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPHP41219 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPHP41219 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPHP41219 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPHP41219 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPHP41219 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPHP41219 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPHP41219 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPHP41219 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPHP41219 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPHP41219 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPHP41219 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPHP41219 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPHP41219 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPHP41219 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPHP41219 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPHP41219 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPHP41219 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPHP41219 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPHP41219 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPHP41219 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRPHP41219 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPHP41219 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPHP41219 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPHP41219 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPHP41219 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPHP41219 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPHP41219 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPHP41219 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRPHP41219 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPHP41219 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPHP41219 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPHP41219 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPHP41219 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPHP41219 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPHP41219 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPHP41219 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPHP41219 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPHP41219 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRPHP41219 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPHP41219 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPHP41219 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPHP41219 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPHP41219 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPHP41219 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPHP41219 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPHP41219 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPHP41219 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPHP41219 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPHP41219 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPHP41219 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPHP41219 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPHP41219 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPHP41219 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPHP41219 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPHP41219 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPHP41219 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPHP41219 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPHP41219 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRPHP41219 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPHP41219 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPHP41219 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPHP41219 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPHP41219 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPHP41219 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPHP41219 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPHP41219 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPHP41219 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPHP41219 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPHP41219 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPHP41219 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPHP41219 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPHP41219 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPHP41219 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPHP41219 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPHP41219 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms