Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms