Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DDIT3P35638 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDIT3P35638 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms