Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA6P31267 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA6P31267 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA6P31267 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA6P31267 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA6P31267 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA6P31267 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA6P31267 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA6P31267 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA6P31267 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA6P31267 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA6P31267 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA6P31267 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA6P31267 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA6P31267 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA6P31267 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA6P31267 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA6P31267 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA6P31267 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA6P31267 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXA6P31267 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms