Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PVALBP20472 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PVALBP20472 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PVALBP20472 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PVALBP20472 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PVALBP20472 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PVALBP20472 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PVALBP20472 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PVALBP20472 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PVALBP20472 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PVALBP20472 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PVALBP20472 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PVALBP20472 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PVALBP20472 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PVALBP20472 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PVALBP20472 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PVALBP20472 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PVALBP20472 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PVALBP20472 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PVALBP20472 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PVALBP20472 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PVALBP20472 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PVALBP20472 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PVALBP20472 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PVALBP20472 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PVALBP20472 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PVALBP20472 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PVALBP20472 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PVALBP20472 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PVALBP20472 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PVALBP20472 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PVALBP20472 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PVALBP20472 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PVALBP20472 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PVALBP20472 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PVALBP20472 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PVALBP20472 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PVALBP20472 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PVALBP20472 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PVALBP20472 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PVALBP20472 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms