Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP2B1P20020 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP2B1P20020 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms