Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYN1P17600 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYN1P17600 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYN1P17600 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYN1P17600 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYN1P17600 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYN1P17600 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYN1P17600 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYN1P17600 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYN1P17600 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYN1P17600 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYN1P17600 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYN1P17600 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYN1P17600 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYN1P17600 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYN1P17600 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYN1P17600 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYN1P17600 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYN1P17600 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYN1P17600 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYN1P17600 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYN1P17600 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYN1P17600 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYN1P17600 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYN1P17600 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYN1P17600 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYN1P17600 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYN1P17600 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYN1P17600 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYN1P17600 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYN1P17600 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYN1P17600 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYN1P17600 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYN1P17600 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYN1P17600 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYN1P17600 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYN1P17600 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYN1P17600 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYN1P17600 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYN1P17600 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYN1P17600 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYN1P17600 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYN1P17600 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYN1P17600 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYN1P17600 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYN1P17600 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYN1P17600 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYN1P17600 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYN1P17600 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYN1P17600 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYN1P17600 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYN1P17600 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYN1P17600 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYN1P17600 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYN1P17600 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYN1P17600 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYN1P17600 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYN1P17600 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYN1P17600 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYN1P17600 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYN1P17600 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYN1P17600 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYN1P17600 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYN1P17600 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYN1P17600 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN1P17600 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN1P17600 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN1P17600 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN1P17600 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN1P17600 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN1P17600 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN1P17600 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN1P17600 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN1P17600 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN1P17600 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN1P17600 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN1P17600 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN1P17600 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN1P17600 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN1P17600 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN1P17600 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYN1P17600 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN1P17600 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN1P17600 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN1P17600 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN1P17600 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN1P17600 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN1P17600 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN1P17600 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN1P17600 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN1P17600 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN1P17600 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN1P17600 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYN1P17600 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN1P17600 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN1P17600 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN1P17600 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN1P17600 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN1P17600 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYN1P17600 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms