Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTLA4P16410 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms