Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYL1P12980 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYL1P12980 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYL1P12980 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYL1P12980 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYL1P12980 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYL1P12980 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYL1P12980 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYL1P12980 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYL1P12980 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LYL1P12980 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYL1P12980 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYL1P12980 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYL1P12980 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYL1P12980 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYL1P12980 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYL1P12980 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYL1P12980 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYL1P12980 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYL1P12980 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYL1P12980 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYL1P12980 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYL1P12980 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYL1P12980 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYL1P12980 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYL1P12980 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYL1P12980 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYL1P12980 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LYL1P12980 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYL1P12980 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYL1P12980 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYL1P12980 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYL1P12980 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYL1P12980 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYL1P12980 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYL1P12980 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYL1P12980 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYL1P12980 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYL1P12980 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYL1P12980 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LYL1P12980 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYL1P12980 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYL1P12980 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYL1P12980 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYL1P12980 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYL1P12980 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYL1P12980 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYL1P12980 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYL1P12980 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYL1P12980 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LYL1P12980 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYL1P12980 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LYL1P12980 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYL1P12980 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYL1P12980 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYL1P12980 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYL1P12980 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LYL1P12980 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LYL1P12980 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYL1P12980 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYL1P12980 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYL1P12980 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYL1P12980 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYL1P12980 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYL1P12980 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYL1P12980 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYL1P12980 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYL1P12980 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LYL1P12980 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LYL1P12980 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms