Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA6AP0CW24 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA6AP0CW24 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms