Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXB5P09067 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms