Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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PKHD1P08F94 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PKHD1P08F94 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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