Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNAP29O95721 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP29O95721 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP29O95721 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP29O95721 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP29O95721 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP29O95721 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP29O95721 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP29O95721 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP29O95721 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP29O95721 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP29O95721 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP29O95721 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP29O95721 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP29O95721 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP29O95721 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP29O95721 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP29O95721 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNAP29O95721 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms