Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN15O75808 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN15O75808 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms