Protein–RNA interactions for Protein: O75762

TRPA1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPA1O75762 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRPA1O75762 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms