Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
N4BP1O75113 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
N4BP1O75113 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms