Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNA1GO43497 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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