Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SYNJ2O15056 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SYNJ2O15056 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms