Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASKO14936 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASKO14936 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CASKO14936 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASKO14936 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASKO14936 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CASKO14936 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASKO14936 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASKO14936 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASKO14936 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASKO14936 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASKO14936 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASKO14936 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASKO14936 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASKO14936 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASKO14936 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASKO14936 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASKO14936 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASKO14936 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASKO14936 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CASKO14936 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CASKO14936 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASKO14936 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASKO14936 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASKO14936 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASKO14936 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASKO14936 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASKO14936 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASKO14936 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CASKO14936 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CASKO14936 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASKO14936 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASKO14936 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASKO14936 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASKO14936 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASKO14936 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASKO14936 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASKO14936 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASKO14936 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASKO14936 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CASKO14936 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASKO14936 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASKO14936 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASKO14936 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASKO14936 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASKO14936 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASKO14936 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASKO14936 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CASKO14936 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASKO14936 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASKO14936 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASKO14936 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASKO14936 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CASKO14936 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASKO14936 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASKO14936 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASKO14936 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASKO14936 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CASKO14936 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASKO14936 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASKO14936 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CASKO14936 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CASKO14936 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms