Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFKBIEO00221 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms