Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00587B1AMM8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms