Protein–RNA interactions for Protein: A6NIN4

Putative uncharacterized protein FLJ38447, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIN4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
A6NIN4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
A6NIN4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A6NIN4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
A6NIN4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A6NIN4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A6NIN4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A6NIN4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A6NIN4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A6NIN4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A6NIN4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A6NIN4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A6NIN4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A6NIN4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A6NIN4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A6NIN4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A6NIN4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A6NIN4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A6NIN4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A6NIN4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A6NIN4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A6NIN4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A6NIN4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A6NIN4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A6NIN4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A6NIN4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
A6NIN4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A6NIN4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
A6NIN4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
A6NIN4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
A6NIN4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
A6NIN4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
A6NIN4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A6NIN4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
A6NIN4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A6NIN4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A6NIN4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
A6NIN4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A6NIN4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A6NIN4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
A6NIN4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A6NIN4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
A6NIN4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
A6NIN4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
A6NIN4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A6NIN4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A6NIN4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A6NIN4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A6NIN4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
A6NIN4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A6NIN4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
A6NIN4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
A6NIN4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A6NIN4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A6NIN4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A6NIN4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A6NIN4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A6NIN4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A6NIN4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A6NIN4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A6NIN4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A6NIN4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A6NIN4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A6NIN4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A6NIN4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A6NIN4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A6NIN4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A6NIN4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A6NIN4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A6NIN4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A6NIN4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A6NIN4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A6NIN4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
A6NIN4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
A6NIN4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms