Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD3A2A2Y4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms