Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRPC6Q9Y210 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRPC6Q9Y210 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms