Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC23Q9UJX2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC23Q9UJX2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms