Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC59Q9P031 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC59Q9P031 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms