Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMPD3Q9NY59 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMPD3Q9NY59 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms