Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV58

RNF19A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19AQ9NV58 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF19AQ9NV58 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF19AQ9NV58 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms