Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRDM10Q9NQV6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM10Q9NQV6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms