Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SYCP2Q9BX26 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYCP2Q9BX26 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms