Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NDUFAF3Q9BU61 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms