Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C2orf88Q9BSF0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms