Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD5Q99666 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD5Q99666 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms