Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GCNAQ96QF7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms